La de Sudáfrica aún no se encontró y además se observan mutaciones de las variantes

Buenos Aires-(Nomyc)-Un reporte donde muestra la secuenciación parcial del gen que codifica para la proteína Spike en 81 muestras de CABA y la Provincia de BuenosAiresobtenidas entre el 27 de enero y el 21 de febrero  correspondientes a casos de circulación comunitaria, viajeros internacionales o contactos de viajeros internacionales fue presentado por el Proyecto PAIS (PROYECTO ARGENTINO INTERINSTITUCIONAL DE GENÓMICA DE SARS-COV-2), creado desde el Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación.

Se detectó la combinación de mutaciones característica de la variante 501Y.V3 o variante Manaos en dos muestras, y la de la variante 501Y.V1 o del  Reino Unido, en una muestra, mientras que también se detectó la mutaciónS_E484K, característica de la variante P.2 o de Río de Janeiro, en 15 muestras y la mutación S_E484Q en un caso, pero no se detectó la combinación de mutaciones característica de la variante 501Y.V2 o de Sudáfrica y en todos los casos reportados de las variantes, se procederá a la secuenciación del genoma completo.

Variantes de interés y mutaciones: “arrancamos la vigilancia con el fin de buscar estas variantes, denominados en inglés, Variants of Concern (VoC), que empezaron a emerger en el mundo y tomaron el interés de todos los científicos y la estrategia inicial fue detectar cierta constelación de mutaciones de las variantes501Y.V1 o del Reino Unido, la 501Y.V2 o de Sudáfrica y la 501Y.V3 o de Manaos, pero sin embargo, empezamos a detectar la mutación S_E484K sola, no asociada al resto de las encontradas en las variantes 501Y.V2 y 501Y.V3” explicó la coordinadora del Consorcio PAIS, investigadora en el Laboratorio de Virología Hospital de Niños Ricardo Gutiérrez, Dra. Mariana Viegas, respecto a las mutaciones.

“En las sucesivas investigaciones, la mutación comenzó a aumentar la frecuencia en AMBA, en particular. Como no sabemos el origen, o sea si se debe a la variante de Rio de Janeiro, estamos haciendo el genoma completo para confirmarlo o determinar si se debe a una nueva variante local que haya emergido por convergencia evolutiva, es decir que una misma mutación que aparece en virus de linajes distintos y es por eso, que ahora nos detenemos a hablar de variantes VOC y de mutaciones que estén asociadas con alguna característica fenotípica que genere interés a nivel local y global” agregó Viegas.

Uno de los casos que presentó la variante de Manaos tuvo antecedente de viaje a Pipa, Brasil, y el otro habría sido contacto de otro viajero, también procedente de Brasil, mientras que en el caso de la variante de Reino Unido habría sido adquirido en la comunidad.

A modo de resumen, la vigilancia activa de las variantes de SARS-CoV-2 realizada sobre un total de 626 muestras de la CABA, provincia de Buenos Aires, Córdoba y la ciudad de Santa Fe obtenidas entre el 1 de noviembre de 2020 y el 21 de febrero de 2021, permitió determinar la presencia de tres variantes de interés epidemiológico mundial en nuestro país: la variante 501Y.V1 o del Reino Unido, la variante 501Y.V3 o de Manaos y la variante P.2 o de Río de Janeiro y hasta el momento, la 501Y.V1 o de Reino Unido se identificó en cuatro casos, es decir un 0,6 por ciento; mientras que la   501Y.V3 o Manaos, en 2 casos es decir un 0,3 por ciento y la mutación S_E484K en forma aislada, compatible con P.2 o de Río de Janeiro, en 43 casos, lo que representa un 6,9 por ciento y la mutación S_L452R/Q/M en 7 casos.

Recordemos que las cuatro variantes virales del SARS-CoV-2 son la variante 501Y.V1 (linaje B.1.1.7) o VOC 202012/01, detectada en el Reino Unido; 501Y.V2 (linaje B.1.351) o VOC 202012/02, detectada en Sudáfrica; la variante 501Y.V3 (linaje P.1, derivado del linaje B.1.1.28) o VOC 202101/02, detectada en Manaos, Brasil; y la variante VUI-202101/01 (linaje P.2, derivado del linaje B.1.1.28), detectada en Río de Janeiro, Brasil.

Sobre Proyecto PAIS: creado desde el Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación de la Nación, el Consorcio interinstitucional para la Secuenciación del genoma y estudios genómicos de SARS-CoV-2 (Proyecto PAIS) está conformado por grupos de investigación de diferentes instituciones con el objetivo de secuenciar el genoma y realizar demás estudios genómicos del SARS-CoV-2.

Coordinado por la Dra. Mariana Viegas del Laboratorio de Virología Hospital de Niños Ricardo Gutiérrez, el equipo trabaja articulada y colaborativamente para realizar estudios genómicos de SARS-CoV-2 en nuestro país y aportar tanto al conocimiento local como a la base de datos global de circulación viral GISAID (Global Initiative on Sharing All Influenza Data). Entre sus objetivos se encuentran la secuenciación de los genomas circulantes de SARS-CoV-2 en distintas regiones de nuestro país, el análisis a gran escala de secuencias, ensamblado de genomas, análisis filogenéticos y filogeográficos, epidemiología y evolución molecular.

Para conocer más ingresar a http://pais.qb.fcen.uba.ar/

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