El genoma completo del coronavirus de Wuhan ya está disponible en una de las aplicaciones web más conocidas para obtener este tipo de información y su  secuencia, de 29 903 letras, estará a disposición de los investigadores para conocer mejor el funcionamiento del virus e identificar sus puntos débiles

Buenos Aires-(Nomyc)-El coronavirus de Wuhan,  cuyo nombre oficial es 2019-nCoV, ya es responsable de más de 900 muertes y más de 40 mil personas infectadas en  todo el mundo y conocer el genoma del virus, así como las diferentes versiones  que pueden encontrarse en los pacientes, tiene importantes aplicaciones epidemiológicas y biomédicas ya que es el primer paso para investigar el origen del virus y estudiar su evolución y propagación, así como un elemento clave a la hora de desarrollar una vacuna para impedir la infección.

Por ejemplo, gracias al análisis del genoma del virus, se estima que hubo un único caso de transmisión del virus a humanos y el resto de infecciones se corresponde a transmisiones entre personas.

Como parte de los esfuerzos destinados para conocer mejor al nuevo agente infeccioso, el Instituto de Genómica de la Universidad de California Santa Cruz (UCSC) incluyó la secuencia de su genoma en su conocido navegador de genomas, el UCSC Genome Browser que incorpora la información de las diferentes secuencias del coronavirus 2019-nCoV obtenidas de muestras de pacientes y depositadas en el repositorio internacional del Instituto Nacional de Biotecnología (NCBI) de EEUU.

Dentro de las diferentes herramientas de análisis del genoma, el navegador de la universidad UCSC incluye una específica para identificar qué secciones del genoma son susceptibles de ser modificadas mediante el sistema de edición del genoma CRISPR y esta característica podría facilitar la investigación sobre qué genes o regiones del genoma son más interesantes para desarrollar estrategias terapéuticas.

El coronavirus 2019-cCoV “tiene unos 10 genes”, informa Hiram Clawson, ingeniero en el UCSC Genome Browser quien agrega que “entre ellos, se destaca el gen de mayor tamaño del genoma del coronavirus, que codifica para una estructura que el virus utiliza para entrar en las células y secuestrar la maquinaria de la célula para reproducirse”.

Clawson señala que “cambios en este gen podrían afectar a la virulencia del virus, lo que podría ser relevante a la hora de diseñar una forma atenuada que pudiera actuar como vacuna”.

En paralelo a la publicación del genoma del coronavirus 2019-nCoV en el UCSC Genome Browser, diferentes grupos de investigación dedicados al estudio del coronavirus 2019-nCoV comenzaron a compartir de forma pública las secuencias del virus obtenidas de pacientes infectados para favorecer la investigación.

Uno de los medios elegidos es la plataforma GISAID, una iniciativa creada originalmente para compartir información sobre el virus de la gripe, desde cuya  página de GISAID  pueden descargarse las secuencias del coronavirus proporcionadas por varios países, además de ver en tiempo real el número de infectados en cada país, en todo el mundo o la evolución en el tiempo transcurrido desde la primera infección del genoma del virus.

Tanto el UCSC Genome Browser como GISAID funcionan como repositorios para que los investigadores puedan incluir secuencias del virus y además, el UCSC dispone de múltiples herramientas adicionales para analizar el genoma y GISAID incluye herramientas de análisis de la epidemia y evolución del virus.

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